- Huehuecuetzpalli
- Bellairsia
- Oculudentavis
- Incertae sedis
- Alamitornis
- Tikiguania
- Hakuseps
- Oxiella
- Costasaurus (= Salamandra rusconi ; S. apennina ; Polysema apenninae ; P. rusconi ; Epipolysema rusconi)
- Xianglong
- Hoyalacerta
- Kuroyuriella
- Araeosaurus
- Liaoningolacerta
- Jeholacerta
- Cryptovaranoides
- Paikasisaurus
- Tedorosaurus
- Cuencasaurus
- Asagaolacerta
- Iguanomorpha
- Magnuviator
- Temujiniidae
- Temujina
- Saichangurvel
- Gobiguania
- Igua
- Polrussia
- Anchaurosaurus
- Ctenomastax
- Isodontosaurus
- Zapsosaurus
- Parasauromastyx
- Incertae sedis
- Brasiliguana
- Chamaeleontiformes
- Incertae sedis
- Gueragama
- Protodraco
- Priscagamoidea
- Priscagamidae
- Priscagama
- Sheikhia
- Chamaleognathus
- Cretagama
- Flaviagama
- Phrynosomimus
- Morunasius
- Heterodontagama (genre non-mésozoïque)
- Pleurodontagamidae
- Gladidenagama
- Mimeosaurus
- Pleurodontagama
- Priscagamidae
- Acrodonta (clade non-mésozoïque)
- Incertae sedis
- Pleurodonta
- Incertae sedis
- Pristiguana
- Xihaina
- Cnephasaurus
- Pariguana
- Desertiguana
- Silvaiguana (clade non-mésozoïque)
- Euiguana (clade non-mésozoïque)
- Incertae sedis
- Scincogekkonomorpha
- Pedrerasaurus
- Meyasaurus (= Ilerdaeosaurus ; Rubiessaurus lapicidinarum)
- Yabeinosauridae
- Sakurasaurus
- Jucaraseps
- Yabeinosaurus
- Indrasaurus
- Liushusaurus
- Moqisaurus
- Bavarisauridae
- Bavarisaurus (= Homoeosaurus macrodactylus)
- Scandensia
- Hongshanxi
- Scleroglossa
- Gekkonomorpha
- Norellius
- Ardeosauridae
- Ardeosaurus (= Homoeosaurus brevipes)
- Paleolacerta
- Limnoscansor (= Homoeosaurus digitalellus ; Eichstaettisaurus digitalellus)
- Helioscopus
- Gurvelus
- Schoenesmahl
- Eichstaettisauridae
- Eichstaettisaurus (= Ardeosaurus schroederi ; A. gouldi ; Broilisaurus schroederi)
- Gekkota
- Hoburogekko
- Cadurcogekko (genre non-mésozoïque)
- Cretaceogekko
- Yanatarogecko (genre non-mésozoïque)
- Dollogekko (genre non-mésozoïque)
- Gobekko
- Gekkonoidea (clade non-mésozoïque)
- Pygopodoidea (clade non-mésozoïque)
- Evansauria
- Tijubina
- Tepexisaurus
- Autarchoglossa
- Incertae sedis
- Baabdasaurus
- Polyglyphanodontia
- Incertae sedis
- Paleochelco
- Distortodon
- Obamadon
- Bothriagenys
- Hydrargysaurus
- Olindalacerta
- Kuwajimalla
- Chamopsiidae
- Harmodontosaurus
- Socognathus
- Pelsochamops
- Chamops (= Lanceosaurus ; Alethesaurus ; Iguanius teres)
- Gerontoseps
- Ptilotodon
- Prototeius
- Meniscognathus
- Glyptogenys
- Leptochamops (= Chamops denticulatus)
- Haptosphenus
- Tripennaculus
- Stypodontosaurus
- Mongolochamopidae
- Prodenteia
- Gurvansaurus
- Mongolochamops
- Dzhadochtosaurus
- Buckantaus
- Cyclurasia
- Atlanteius
- Sphenosiagon
- Conicodontosaurus
- Gobinatus
- Barungoia
- Pyramicephalosaurus
- Gilmoreteiidae
- Erdenetesaurus
- Cherminsaurus
- Darchansaurus
- Aprisaurus
- Macrocephaleon (= Naranasaurus ; Macrocephalosaurus chulsanensis ; Gilmoreteius chulsanensis)
- Tchingisaurus
- Gilmoreteius (= Macrocephalosaurus)
- Campedosaurus
- Tuberocephalosaurus
- Gobileon
- Tianyusaurus
- Alticephalosaurus (= Macrocephalosaurus gilmorei ; Gilmoreteius gilmorei)
- Yechilacerta
- Funuisaurus
- Polyglyphanodontidae
- Sineoamphisbaena
- Paraglyphanodon
- Adamisaurus
- Cryptobicuspidon
- Dicothodon (= Polyglyphanodon bajaensis)
- Bicuspidon
- Polyglyphanodon
- Peneteius (= Manangyasaurus)
- Incertae sedis
- Scincomorpha
- Incertae sedis
- Pachygenys
- Kleskunsaurus
- Calanguban
- Apsgnathus
- Parasaurillus (= Saurillus robustidens)
- Lonchisaurus
- Teilhardosaurus
- Schillerosaurus (= Schilleria)
- Chromatogenys
- Tarratosaurus
- Pan-Scincoidea
- Microteras
- Parmeosaurus
- Dimekodontosaurus
- Hymenosaurus
- Monocnemodon
- Webbsaurus
- Dakotaseps
- Globauridae
- Globaura
- Orthrioscincus
- Khereidia
- Durotrigia
- Contogeniidae
- Contogenys
- Utahgenys
- Palaeoscincosaurus
- Scincoidea
- Xantusiomorpha
- Slavoiidae
- Slavoia
- Carusiidae
- Dalinghosaurus
- Shinisauroides
- Myrmecodaptria
- Carusia
- Eoxantidae
- Eoxanta
- Paleoxanta
- Bainguidae
- Bainguis
- Hodzhakuliidae
- Hodzhakulia
- Dibamidae (clade non-mésozoïque)
- Pan-Xantusiidae
- Retinosaurus
- Catactegenys
- Xantusiidae (clade non-mésozoïque)
- Slavoiidae
- Leptoglossa
- Paramacellodidae
- Atokasaurus
- Aocnodromeus
- Penemabuya
- Ilekia
- Pseudosaurillus
- Eoscincus
- Becklesius (= Macellodus brodiei ; Becklesisaurus hoffstetteri)
- Mimobecklesisaurus
- Estescincosaurus (= Sauriscus cooki)
- Saurillodon (= Saurillus proraformis ; S. henkeli)
- Naimanosaurus
- Sharovisaurus
- Changetisaurus
- Balnealacerta
- Hypostylos
- Sciroseps
- Paramacellodus (= Becklesisaurus scincoides)
- Neokotus
- Saurillus
- Cordyliformes
- Konkasaurus
- Deccansaurus
- Cordylidae (clade non-mésozoïque)
- Scincidae
- Electroscincus
- Egerniinae (clade non-mésozoïque)
- Sphenomorphinae (clade non-mésozoïque)
- Eugongylinae (clade non-mésozoïque)
- Mabuyinae (clade non-mésozoïque)
- Lygosominae (clade non-mésozoïque)
- Acontinae (clade non-mésozoïque)
- Scincinae (clade non-mésozoïque)
- Paramacellodidae
- Xantusiomorpha
- Lacertoidea
- Purbicella
- Barbatteiidae
- Barbatteius
- Oardasaurus
- Amphisbaenia (clade non-mésozoïque)
- Teiidae (clade non-mésozoïque)
- Lacertidae (clade non-mésozoïque)
- Incertae sedis
- Toxicofera
- Pythonomorpha
- Incertae sedis
- Carentonosaurus
- Segurasaurus (= Carentonosaurus soaresi)
- Mesoleptos
- Mosasauroidea
- Portunatasaurus
- Opetiosaurus (= Aigialosaurus buccichi)
- Vallecillosaurus
- Aigialosaurus
- Proaigialosaurus
- Carsosaurus
- Mosasauridae
- Incertae sedis
- Capelliniosuchus
- Sironectes (= Platecarpus anguliferus):
- Macrosaurus (= Mosasaurus laevis ; Tylosaurus laevis)
- Amphorosteus (= Mosasaurus brumbyi)
- Kaikaifilu
- Russellosaurina
- Haasiasaurus
- Komensaurus
- Sarabosaurus
- Plioplatecarpinae
- Ectenosaurus (= Platecarpus clidastoides ; P. oxyrhinus)
- Angolasaurus (= Platecarpus bocagei)
- Selmasaurini
- Goronyosaurus (= Mosasaurus nigeriensis)
- Khinjaria
- Gavialimimus
- Selmasaurus
- Plioplatecarpini
- Latoplatecarpus (= Plioplatecarpus nichollsae)
- Plioplatecarpus (= Oterognathus ; Platecarpus brachycephalus ; P. primaevus ; P. crassartus ; Mosasaurus depressus ; M. copeanus ; Halisaurus fraternus ; Liodon laticaudus ; L. crassartus ; Tylosaurus laticaudus ; Prognathodon crassartus)
- Platecarpus (= Lestosaurus ; Holosaurus ; Holcodus ; Liodon mudgei ; L. ictericus ; I. curtirostris ; Rhinosaurus mudgei)
- Plesioplatecarpus (= Clidastes planifrons ; Platecarpus planifrons)
- Yaguarasaurinae
- Russellosaurus
- Yaguarasaurus
- Romeosaurus
- Tethysaurinae
- Pannoniasaurus
- Tethysaurus
- Tylosaurinae
- Tylosaurus (= Elliptonodon ; Rhinosaurus ; Rhamphosaurus ; Hainosaurus ; Macrosaurus proriger ; Liodon proriger ; L. micromus ; L. nepaeolicus)
- Taniwhasaurus (= Lakumasaurus ; Yezosaurus ; Platecarpus oweni ; Liodon haumuriensis ; Tylosaurus haumuriensis ; Mosasaurus mokoroa)
- Halisaurinae
- Eonatator (= Clidastes sternbergii ; Halisaurus sternbergii)
- Pluridens (= Halisaurus walkeri)
- Halisaurus (= Baptosaurus)
- Phosphorosaurus (= Halisaurus ortliebi)
- Mosasaurinae
- Kourisodon
- Liodon (= Mosasaurus stenodon ; M. anceps ; Prognathodon sectorius ; Tylosaurus sectorius)
- Jormungandr
- Dallasaurus
- Clidastes (= Edestosaurus)
- Incertae sedis
- Stelladens
- Prognathodontini
- Thalassotitan
- Plesiotylosaurus
- Prognathodon (= Ancylocentrum ; Brachysaurana ; Dollosaurus ; Prognathosaurus ; Tenerasaurus ; Mosasaurus donicus ; M. giganteus ; M. platyodon ; Liodon compressidens ; L. mosasauroides)
- Gnathomortis (= Prognathodon stadtmani)
- Globidensini
- Globidens (= Platecarpus intermedius ; Clidastes intermedius)
- Carinodens (= Compressidens ; Bottosaurus belgicus ; Globidens belgicus ; G. fraasi)
- Xenodens
- Harranasaurus
- Igdamanosaurus (= Globidens aegyptiacus)
- Mosasaurini
- Moanasaurus (= Rikisaurus ; Mosasaurus flemingi)
- Eremiasaurus
- Plotosaurus (= Garzasaurus ; Kolposaurus tuckeri ; K. bennisoni)
- Megapterygius
- Bentiabasaurus
- Mosasaurus (= Amphekepubis ; Batrachiosaurus ; Baseodon ; Lesticodus ; Batrachotherium ; Nectoportheus ; Pterycollosaurus ; Lacerta gigantea ; Ichthyosaurus missouriensis ; Clidastes iguanavus ; Clidastes conodon ; Liodon lundgreni ; Plesiosaurus scanicus ; Drepanodon impar)
- Incertae sedis
- Ophidiomorpha
- Dolichosauridae
- Primitivus
- Coniasaurus
- Acteosaurus (= Mesoleptos zendrini)
- Dolichosaurus
- Eidolosaurus
- Judeasaurus
- Aphanizocnemus
- Pontosaurus (= Hydrosaurus)
- Adriosaurus (= Acteosaurus crassicostatus)
- Tetrapodophis
- Kaganaias
- Ophidia
- Parviraptor
- Diablophis
- Dinilysia
- Najash
- Portugalophis
- Eophis
- Coniophis
- Incertae sedis
- Norisophis
- Lunaophis
- Xiaophis
- Lapparentophiidae
- Lapparentophis
- Pouitella
- Simoliophiidae
- Eupodophis (= Podophis descouensi)
- Pachyophis
- Simoliophis
- Pachyrhachis (= Estesius ; Ophiomorphus)
- Haasiophis
- Mesophis
- Scolecophidia
- Boipeba
- Australophis
- Anomalepididae (clade non-mésozoïque)
- Leptotyphlopidae (clade non-mésozoïque)
- Typhlopoidea (clade non-mésozoïque)
- Alethinophidia
- Cerberophis
- Madtsoiidae
- Seismophis
- Menarana
- Nanowana (genre non-mésozoïque)
- Eomadtsoia
- Rionegrophis
- Gigantophis (genre non-mésozoïque)
- Adinophis
- Powellophis (genre non-mésozoïque)
- Madtsoia
- Vasuki (genre non-mésozoïque)
- Alamitophis
- Nidophis
- Herensugea
- Platyspondylophis (genre non-mésozoïque)
- Sanajeh
- Yurlunggur (genre non-mésozoïque)
- Patagoniophis
- Nigerophiidae
- Kelyophis
- Nigerophis (genre non-mésozoïque)
- Woutersophis (genre non-mésozoïque)
- Nubianophis
- Indophis
- Nessovophis (genre non-mésozoïque)
- Afrophidia
- Henophidia (clade non-mésozoïque)
- Caenophidia
- Anomalophioidea (clade non-mésozoïque)
- Russellophiidae
- Krebsophis
- Russellophis (genre non-mésozoïque)
- Acrochordiidae (clade non-mésozoïque)
- Colubroides (clade non-mésozoïque)
- Amerophidia (clade non-mésozoïque)
- Dolichosauridae
- Incertae sedis
- Anguimorpha
- Incertae sedis
- Barlochersaurus
- Colpodontosaurus
- Chometokadmon
- Dorsetisauridae
- Dorsetisaurus (= Introrsisaurus)
- Paradorsetisaurus
- Paravaranidae
- Paravaranus
- Neoanguimorpha
- Monstersauria
- Asprosaurus
- Paraderma
- Ekshmer
- Parviderma
- Chianghsia
- Morohasaurus
- Primaderma
- Labrodioctes
- Helodermatidae (clade non-mésozoïque)
- Diploglossa
- Xenosauridae
- Exostinus
- Cnodontosaurus
- Xenosaurus (genre non-mésozoïque)
- Xenostius
- Shestakovia
- Blutwurstia (genre non-mésozoïque)
- Restes (genre non-mésozoïque)
- Oxia
- Anguioidae
- Diploglossidae (clade non-mésozoïque)
- Anniellidae (clade non-mésozoïque)
- Anguidae
- Odaxosaurus (= Peltosaurus piger ; P. prisci ; Pancelosaurus piger)
- Anguinae (clade non-mésozoïque)
- Gerrhonotinae (clade non-mésozoïque)
- Glyptosaurinae (clade non-mésozoïque)
- Xenosauridae
- Monstersauria
- Paleoanguimorpha
- Shinisauria (clade non-mésozoïque)
- Platynota
- Cemeterius
- Litakis
- Arcanosaurus
- Varanoidea
- Aiolosaurus
- Estesia
- Parasaniwa
- Gobiderma
- Palaeosaniwa
- Dryadissector
- Paleovaranidae (clade non-mésozoïque)
- Pachyvaranidae
- Pachyvaranus
- Lanthanotidae
- Lanthanotus (genre non-mésozoïque)
- Cherminotus
- Varanidae
- Ovoo
- Saniwa (genre non-mésozoïque)
- Archaeovaranus (genre non-mésozoïque)
- Saniwides
- Proplatynotia
- Telmasaurus
- Varanus (genre non-mésozoïque)
- Incertae sedis
- Pythonomorpha
- Incertae sedis
- Gekkonomorpha